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用户名:nnnhg 笔名:一山群峰外 地区: 湖北-武汉 行业:理学 |
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生物学杂志(转)
衡量一本杂志质量很大程度上是看SCI(Science Citation Index,科学引文索引)的impact factor(IF), 这个是由美国科学情报研究所(Institute for Scientific Information, ISI)从1960年编辑出版的检索工具,ISI在1992年被Thomson Scientific & Healthcare收购,现在已经成为Thomson ISI。
http://scientific.thomson.com/
http://scientific.thomson.com/products/sci/
如果想查询IF,http://www.proteomics.com.cn/sci-if/,这里能查到杂志IF的历年趋势。下面的IF是2005年的。
《科学》Science IF: 30.927
http://www.sciencemag.org/
http://china.sciencemag.org/
美国科学促进会(American Association for the Advancement of Science,AAAS),周刊,总部:Washington, D.C., USA。
1880年,纽约新闻记者John Michaels创立了Science杂志,这份杂志先后得到了Thomas Edison(伟人阿)以及Alexander Graham Bell的资助。在初期,Science由于财政困难发展并不是很顺利,曾经以500美元(不是现在的500USD,那时候也很多钱了)的价格转让。1944年AAAS成为Science新主人。Science不仅发表重要原创的科学研究论文,还发表与科学发展有关的新闻,观点,政策,或是科学家感兴趣的事件。Science发表的内容涵盖了各个科学学科,天文考古,物理化学等等,但是最近几十年来重点发表关于生物学和生命科学相关的论文,这得益于生物技术和基因学的迅速发展(Nature和PNAS也是)。在Science上发表自己的文章对科学家而言是相当光荣的,同样竞争也相当厉害,在全部投稿的论文里只有少于十分之一能接受。主要竞争对手是英国出版的Nature杂志
《自然》Nature IF:29.2732
http://www.nature.com/nature/index.html
http://www.nature.com/index.html
自然出版集团(Nature Publishing Group,NPG),周刊,总部:London,UK。
在看自然的出版商的时候晕了,NPG属于麦克米伦出版有限公司(Macmillan Publishers Ltd.),而后者又属于格奥尔格·冯·霍茨布林克出版集团(Georg von Holtzbrinck Publishing Group),好复杂的关系
NPG还出版了很多Nature的子刊,像下面会提到的Nature Medicine,也都有很高的IF。值得一提的是特别的Nature China,关注中国科学家的发展,有兴趣可以去看看http://www.naturechina.com.cn/nchina/index.html
Nature首版于1869年11月4日。Nature和Science基本一样,两者的IF也差不多,在科学界的影响力两者也差不多,一个泰山,一个北斗,哈! 人类的重要科学发现基本上是这两者上发表的。
在这两个杂志发的文章,都要经过严格的peer-review,但是也都曾经有过严重的数据造假问题,像2000年到2001年,数篇德国人Jan Hendrik Schon的造假论文(都是什么凝聚态物理,纳米材料之类的)被录用,2002年10月31日,Science撤销了Schon的8篇论文,2003年3月5日,Nature撤销了其7篇论文(这么短时间发这么多高质量的文章太可疑,如果都是真的话,就太厉害了,当然有这种杰出的科学家 ),最近的造假丑闻就是生物领域的韩国汉城国立大学的黄教授了 。
但是有一篇奠定现代生物学基础的最重要的论文没有经过peer-review,呵呵。就是1953年的Molecular structure of Nucleic Acids: A structure for deoxyribose nucleic acid. J. D. Watson and F. H. C. Crick. Nature 171: 737–738 ,用主编的话说:“"the Watson and Crick paper was not peer-reviewed by Nature... the paper could not have been refereed: its correctness is self-evident. No referee working in the field ... could have kept his mouth shut once he saw the structure...”Nobel Prize当之无愧 。
两本杂志的论文基本上都是有突破性质的发现,看了上面的文章会发现都是用金钱人力支撑起来的excellent idea
两者都已经在网站提供了mp3文件,就像杂志的新闻联播,分别叫Science Podcast,Nature Podcast,看来iPod 的确流行啊,下到你的mp3 player里面就能听了,还能练习一下听力,不过专业单词实在太多了。还有很多杂志现在都提供了类似的mp3服务,两者网站上都有jobs的信息,有空看看说不定会有惊喜的发现。
《自然医学》 Nature Medicine IF: 28.8788
http://www.nature.com/nm/index.html
自然出版集团(Nature Publishing Group,NPG),自然子刊之一,月刊。
1995建刊,主要发表生物医学基础研究和早期临床研究。主题包括肿瘤,心血管疾病,基因治疗,免疫学,疫苗和神经科学。杂志的主旨是“demonstrate novel insight into disease processes, with direct evidence of the physiological relevance of the results”; W8 n* w4
NPG还有下面几本高IF的杂志,都是Nature的子刊.
《自然免疫学》 Nature Immunology IF: 27.0119
《自然遗传学》 Nature Genetics IF: 25.797
《自然生物技术》 Nature Biotechnology IF: 22.7382
《自然细胞生物学》 Nature Cell Biology IF: 19.717
《自然神经科学》 Nature Neuroscience IF: 15.456
http://www.nature.com/siteindex/index.html这里有目录
NPG还有一本国内的杂志(英文杂志),《细胞研究》Cell Research IF: 3.426(很不错了 ), http://www.nature.com/cr/index.html,是中国科学院上海生命科学研究院主办的(这本升的很快)。
《细胞》 Cell IF:29.431
http://www.cell.com/
细胞出版社(Cell Press),双周刊
1976年建刊,发表实验生物学领域的原创研究论文的杂志。读了几次Cell的论文,发现其难度要胜过Nature和Science,Cell不仅要有重大的意义,而且实验论证的过程要求十分完善严谨,有可能这个杂志是专攻生物领域的,不像Nature和Science那样杂。我看来Cell是生命科学基础研究的Top 1 。
Cell Press也出版不少杂志:Cancer Cell IF:18.725, Neuron IF: 14.304,Developmental Cell IF:14.609,Molecular Cell IF:14.971,Immunity IF:15.156,Current Biology IF:11.732,都是该领域的大牛
在Science,Nature,Cell发一篇,有些人就可以吃一辈子了。
《美国国家科学院院刊》 Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, PNAS IF: 10.2314
是美国国家科学院的官方科学杂志(看名字就知道那里出版的了),周刊
http://www.pnas.org/
创刊于1915年。该刊与Nature和Science一样,覆盖生物学,物理学,数学和社会科学等各个学科(现在也是以生命科学为主拉)。该刊为周刊。虽然影响因子不是那么拔高,但是总引用次数很高(最高的是JBC,然后是Science和Nature,后面就是PNAS了),所以影响力巨大。
《生物化学周刊》The Journal of Biological Chemistry, JBC IF: 5.854
美国生物化学和分子生物学协会,American Society for Biochemistry and Molecular Biology, 周刊
http://www.jbc.org/
1905年创建,估计最为人熟知了,其总引用次数很多年保持最高了。2005年达404397次,但是由于发表的论文太多太杂,IF反而低了,在图书馆看见JBC的真面目后就知道了,每周都出一期像字典一样厚的一本,能砸死人,而且字也很小。相比下Science和Nature就薄多了,呵呵。这从一个方面也反映了分子生物学的发展。JBC的全文基本都是免费的,很不错
《基因和发育》 Genes & Development,Gene Deve IF:15.612
冷泉港实验室出版社 Cold Spring Harbor Laboratory Press
http://www.genesdev.org/
http://www.cshl.edu/
冷泉港实验室出版社大家应该知道吧,著名的《分子克隆实验指南》就是这个出版社的。冷泉港实验室也是大牛无数,曾经有85位诺贝尔奖获得者同它有关系。Genes & Development是发育生物学的Top 1。1987年开始。
《PLOS生物学》, PLOS是Public Library of Science的缩写,PLOS Biology, PLOS Biol IF: 14.6721
http://biology.plosjournals.org
一本2003年10月刚建立的杂志,背景很大,历史太短了。文章也好像也都是免费的。还有几本PLOS打头的杂志,也都不错的。
《欧洲分子生物学组织杂志》EMBO Journal EMBO J IF: 10.053
欧洲分子生物学组织 European Molecular Biology Organization 双周刊
自然出版集团 Nature Publishing Group
http://embojournal.npgjournals.com/emboj/index.html
又是npg的,分子生物学的牛刊。
《美国实验生物学会联合会》 FASEB Journal FASEB J IF:7.064
http://www.fasebj.org/
http://www.faseb.org/
生物期刊网址
http://www.bio-address.com/cn/bio/magzine/magazine.html
SCI编辑教你如何做科研
一、研究生必备四本
俗话说好记性不如烂笔头,所以一定要首先养成做笔记的好习惯!作为研究生下面这几个本子是必不可少的
1,实验记录本(包括试验准备本),这当然首当其冲必不可少,我就不多说了;
2,Idea记录本,每次看文献对自己有用的东西先记下,由此产生的idea更不能放过,这可是做研究的本钱,好记性不如烂笔头,以后翻翻会更有想法的;
3,专业概念以及理论进展记录本,每个人不可能对自己领域的概念都了如指掌,初入门者更是如此,这时候小小一个本子的作用就大了;
4,讲座记录本,这本本子可能有些零杂,记录听到的内容,更要记录瞬间的灵感,以及不懂的地方,不可小视!
这四本是你必不可少的,不过作为我们这些非英语专业的研究生来说,还有一个应该具备的本子就是英语好句记录本。
二、论文写作要点
1、选题要小,开掘要深;不要题目很大,内容却很单薄。
2、写作前要读好书、翻阅大量资料、注意学术积累,在这个过程中,还要注重利用网络,特别是一些专业数据库
3、“选题新、方法新、资料新”的三新原则(老板教导的)
4、“新题新做”和“小题大做
总之,一点之见即成文。
三、如何撰写实验研究论文(唐朝枢)
论文发表意识:基础研究成果的表达方式;是否急于发表(创新与严谨的关系);发表的论文与学位论文的区别(反映科学事实而不是反映作者水平)
论文格式:原著、快报、简报、摘要。不同于教科书、讲义,更不同于工作总结。
撰写前的准备工作:复习和准备好相关文献;再次审定实验目的(学术思想,Idea);实验资料完整并再次审核
1.Introduction:
问题的提出;研究的现状及背景;以前工作基础;本工作的目的;思路(可提假说);对象;方法;结果。在… 模型上,观察 … 指标, 以探讨 … (目的)
2. M & M
⑴ 材料的写法和意义; 伦理.
⑵ 程序与指标。操作程序:能序贯,可操作性;方法: 多指标方法的排序;引出参照文献简述;改良之处;哪些详或简?⑶ 统计学处理
3. Results
⑴指标归类描述,忌流水帐。不分析不解释,但要体现思路
⑵ 文字、图、表相对独立,但避免重复
⑶ 避免统计错误:对照,均衡,随即,重复。计量-计数、绝对值-相对值、专一指标—综合指标的转换。盲判与非盲判。技术资料直接概率法与卡方检验;多组资料与两组资料;等级相关与直线相关;多因素与单因素分析;配对资料与独立样本资料;非正态分布资料;例数不当;平行管,混合样本;突出差异(绝对值, Δ值,变化%; 联合×、÷比值,分亚组等)有效位数的保留。统计学结论与专业结论。
4. Discussion
⑴ 背景材料:展开问题的提出;有关本研究的一些基本知识内容(不要离题太远)
⑵ 本实验结果分析:各指标的意义(与文献值比较),结果说明什么问题
⑶ 进一步对结果机理分析:结合文献
⑷ 本工作的意义、结语或小结,进一步提出的新问题
其它注意点:
① 引证讨论文献知识太多(不同于学位论文),掩盖了本工作的贡献
② 分析不合逻辑,结论不当
③ 讨论太浮浅,文献知识不熟悉
④ 写成工作总结,缺乏学术高度
⑤ 要正确使用缩写词,尤其是组别缩写词
5. 参考文献:为什么要引文献
⑴ 立论依据的文献:新,权威性文献,不用快报或摘要
⑵ 自己工作的自引:工作连续性
⑶ 实验结果与文献资料比较:新,可用快报, 会议及个人咨询资料
⑷ 方法学:经典文献,注意引文准确,不要转引
6. 摘要:
问题的提出(Background);本工作目的;对象;方法(指标,分组);主要结果(数据,统计);结论与展望
7.再推敲文章题目:不切题,过大、过小
8.投稿:按杂志稿约修定(留底).引用该杂志文章.忌一稿两投
9.致命伤:目的不明确;重复性工作无创新;方法学问题致结果不可信.临床研究:伦理;病例和对照选择;临床关系充分分析
四、如何写好论文讨论部分:科学论文的讨论需要结构化
建议科学论文讨论部分使用的结构:陈述主要发现,本研究的长处和短处、同其它研究比较的长处和短处;特别要讨论结果中的差别、研究的意义、未解答的问题及今后的研究方向
讨论一开始要重新说明主要发现,用一个句子表示较为理想。接着全面说明本研究的长处和短处,两者不可偏废。实际上,编辑和读者最注意研究的短处,这是所有医学研究不可避免的。编辑和读者一旦发现研究的短处,而作者未加讨论,他们对文章的信任会发生动摇,心生疑窦:是否还有他们和作者都未发现的其它弱点呢?
其次,将该研究与以前的工作联系起来,不炫耀自己的工作比以前的工作如何好,而是比较其优劣。与其它研究进行对照,切忌将自己的缺陷掩盖起来。重要的是应该讨论为什么会得出不同于别人的结论,作者可以放开去推测;但是如果弄不清自己的研究结果为什么与别人的结果有差别,就不便作这种推测,也不该断言自已的研究结果正确,而别人的错误。
接着应该讨论自己的研究“表明”什么,如何解释自己的研究发现,以及对临床医生或决策者有什么意义?此刻,作者的境地是危险的,多数编辑和读者能够理解作者的谨慎,不逾实证界限。由读者自己去判断研究的意义:他们是会做到的。作者甚至可以指出研究结果证明不了什么,防止读者得出过度、不实的结论。最后,应点明哪些问题尚未解答,以及要继续做的工作。显然,编辑和读者不喜欢夸大的作法。事实上,作者对论文的这一部分常常写得乱糟糟的。虽然无法阻止作者写一篇充满推测的文章,但切不可因推测而毁了证据。
讨论部分有时也许需要别的小标题,但我们以为,现在提出的结构适合大多数研究论文。尽管统一结构有难度,甚至受限制,我们相信这种结构会降低总的文字长度,防止不恰当的推测和重复,减少报道偏差,提高报道的总体质量。这种设想是完全经得起检验的。我们欢迎BMJ的作者和读者发表观点,如果反映好,我们将使用结构式讨论。
五、关于写英文文章的秘诀
我老板平均每个毕业的博士都有6篇以上的SCI,他从来不强求学生发文章,只教如何做研究。下面的问题,他只和我说过一次,之后我的行动与之不相符就会被骂。现在成了习惯来这样思考,做事,发现真是事半功倍。
1. 你在做研究之前,想过结果能不能发表没有?往哪里发?
2. 写文章的高手是先把文章大框写好,空出数据来,等做完实验,填完空就可以发了。正谓心中有沟壑。
3. 在想不清楚要写什么,要发到哪里去,自己做的与同行做的有什么出色之处,之前,就不要动手做事。去看文献,去想。想不清楚就做,不如不做
要想这样子做,就得先看文献不是?要知道如何把文章架起来,要知道别人是如何讨论的,要知道你自己的数据是不是说明了与别人不一样的东东或别人没有做过。这个过程就是看文献,想的过程,这些搞清楚了,写就简单了。要是先做事,做完发现别人做过,或无法用理论解释,岂不是冤大头?
六、写论文的技巧
优秀论文的要素:1、正确选题;2、合适的切入点;3、简洁明了;4、说清自己的贡献;
5、可靠的/可重现的结果;6、可重复的过程;7、好的文章结构和逻辑流程;8、精选的参考文献
优秀论文的误区:1、Idea越多越好;2、一味追求革命性的,突破性的成果;3、数学、理论和公式越复杂越好——显示自己的聪明;4、追求最好,史无前例;5、显示权威性,引文中大量引用自己的论文。
写文章的条件:1、与研究工作相关,确实有了好的想法,不是为了写而写;2、取得了有价值的成果,对学术界有贡献;3、实验成熟,经得起检验;4、已经需要记录下来和其他人分享
写论文的要点:1、写出3~4层的纲要反复修改多次。2、从Introduction开写,回顾已有的工作。3、要声明文章结构,不要直接进入细节。4、声明工作的动机和基本原理,提出潜在的问题,自己进行回答。5、讲明自己工作与前人的不同,说明自己的贡献及其实际应用前景。6、最后写Summary和Abstract,反复斟酌后确定标题。
Reviewer Check List: 1、论文是否提出了一个新的问题或者给出了已有问题的一个新的解决方案。2、论文的主要结果是什么?3、实验结果是否充分?4、论文技术含量如何?
5、论文是否对所提出的技术/结果的有效性和局限性进行了评价?6、论文写作是否清晰,从而令本行业内多数研究人员可读?7、论文是否适当地引用和介绍了与之相关的历史文献?8、论文是否应该给予嘉奖?
IEEE Transactions on CSVT Review form: 1、在多大的程度上满足本期刊读者的兴趣?
2、论文所使用的方法的评价?3、结果是否具有新颖性?4、主要结果是否正确?5、论述是否清晰?6、是否具有一致性(前/后,论述/结果)?7、引文是否充足?8、Reviewer的意见:(Accept / Accept after a minor revision / Reject / Reject but resubmit after a major revision / Submit to another journal)。
七、论文写作技巧:
1、宣传自己——说明论文的重要性。流程:a)问题X是重要的;b)前人的工作A、B曾经研究过这个问题;c)A、B有一些缺陷;d)我们提出了方法D;e)对D进行实验,和A、B进行比较;f)实验证明D比A、B优越;g)解释为什么D是更优的,而其他的思路(比如E)是不行的;h)阐述D的有效性和局限性;i)对D进一步发展的讨论。要点:j)简洁最重要;k)不犯粗心的错误,仔细验证结果和适当选择用词。
2、细心修改。步骤:a)30%的时间细心思考,70%的时间认真写作初稿;b)把写好的论文放一段时间;c)逐字逐句地阅读论文;d)请其他人帮助阅读和修改;e)在修改的时候,从别人的角度来审视论文(Reviewer / boss / colleagues / proof-reader);f)仔细修改的次数 > 3;修改的总次数 > 5。要点:g)自己读自己的论文很乏味,并且不易找到错误;h)为了论文的小的层次提升,要付出大量劳动。
3、优化英语。步骤:a)自顶向下地组织论文(大纲/逻辑/流程);b)用其他的优秀论文(尤其是同期刊/同系列的论文,优秀书籍)作为范例;c)请别人帮满阅读和修改语法和用词;d)记录自己用词和语法的错误,进行积累。要点:e)用词和语法固然重要,但是结构和逻辑更加重要。
八、优秀论文结构范例:
1、Abstract—— 对自己工作及其贡献的总结:a)阐述问题;b)说明自己的解决方案和结果。
2、Introduction——背景,以及文章的大纲:a)题X是重要的;b)前人的工作A、B曾经研究过这个问题;c)A、B有一些缺陷;d)我们提出了方法D;e)D的基本特征,和A、B进行比较;f)实验证明D比A、B优越;g)文章的基本结构,大纲。
3、Previous Work——说明自己与前人的不同:a)将历史上前人的工作分成类别;b)对每项重要的历史工作进行简短的回顾(一到几句),注意要回顾正确,抓住要点,避免歧义;c)和自己提出的工作进行比较;d)不要忽略前人的重要工作,要公正评价前人的工作,不要过于苛刻;e)强调自己的工作和前人工作的不同,最好举出各自适用例子。
4、Our Work——描述自己的工作,可分成多个部分:a)从读者角度阐明定义和表示法;b)提供算法的伪码,图解和相应解释;c)用设问的方式回答读者可能提出的潜在问题;d)复杂的冗长的证明和细节可以放在附录中,这里关键是把问题阐述清楚;e)特例和例外应该在脚注中给予说明。
5、Experiments——验证提出的方法和思路:a)合理地设计实验(简洁的实验和详尽的实验步骤);b)必要的比较,突出科学性;c)讨论,说明结果的意义;d)给出结论。
6、Conclusion——总结、前景及结文:a)快速简短的总结;b)未来工作的展望;c)结束全文。
7、References——对相关重要背景文献的全面引用:a)选择引文(众所周知的结论不必引用,其他人的工作要引用);b)与前文保持一致。
8、Others——致谢、附录、脚注。
处理被拒:1、理解被国际权威期刊拒稿是一件正常的事情(70%以上被拒),保持良好心态。
2、感谢编辑和Reviewer的意见和工作。3、询问副主编,自己可以怎样处理这篇论文最合适(重投/改投/撤回)。4、继续新的研究或补充修改后改投其他杂志。
常见问题:1、是否可以一稿多投?千万不要!但是一篇会议论文经过修改以后可以再投期刊。2、是否可以建议副主编如何处理自己的论文呢?不行,但可建议他别让某人评阅。3、如4月都未收到副主编回复怎么办?写一封友好的询问信,别催得太紧,别找主编。4、如和副主编意见严重不和怎么办?可以找主编,但是别经常这样做。5、如果和主编的最终决定严重不和怎么办?没有办法了。
植物识别口诀
唐僧写给悟空的考研劝戒信
Nature:气候变暖导致的生物入侵
当前的气候变暖正在导致一些植物和动物的生存范围从较低的纬度和高度向较高的纬度和高度迁移。对15个植物物种的生长状况所做的一项研究表明,向北-西欧扩展其生存范围的外来植物物种与本地种相比,暴露于地面下敌人和地面上广谱草食动物的机会都要少一些。这项工作说明,生存范围向较高纬度和高度迁移的一些植物将是入侵性的,对温带及北纬地区的生物多样性有潜在的有害影响。
Nature 456, 946-948
Successful range-expanding plants experience less above-ground and below-ground enemy impact
天与地的区别
什么是nonsence,什么是make sence?
今天在science上看到的复叶形成机制一文让我想到了很多。诚然,这篇文章设计合理,推论合理,图表neat,该做的方面都做了。但是,它为什么能发science? 和我们的实验比较起来,它强在材料?方法?还是其它?
我们常常抱怨没有实验条件、没有工作基础,可是这篇论文里也没有用到高不可攀的设备仪器、也不用用到需要若干年才能积累的实验材料。
是什么造成了不同?我想答案是在思维上。论文开篇就提出了一个假设,然后从多个方面进行论证,使假设可信。这个假设是全实验的立脚点和精华,但它不是从天而降的假设,而是在多项研究的基础上提出的假设。
法国科学家戴布劳利格总结过他的成功经验:“广见闻、多阅读、勤实验”,这句话也可以用来解释这篇论文的精彩。
复叶形成机制


Diversity in leaf shape is produced by alterations of the margin: for example, deep dissection leads to leaflet formation and less-pronounced incision results in serrations or lobes. By combining gene silencing and mutant analyses in four distantly related eudicot species, we show that reducing the function of NAM/CUC boundary genes (NO APICAL MERISTEM and CUP-SHAPED COTYLEDON) leads to a suppression of all marginal outgrowths and to fewer and fused leaflets. We propose that NAM/CUC genes promote formation of a boundary domain that delimits leaflets. This domain has a dual role promoting leaflet separation locally and leaflet formation at distance. In this manner, boundaries of compound leaves resemble boundaries functioning during animal development.
流水仗之一场混战
上次开会,汪老师说“我一天到晚都在忙,但是到年底想想又好象什么都没有干”。-----GJM
我也处于这种状态
上个周末写博士点申报材料,写了2天,还找LX同学帮忙统计数据。
周一上课,
周二上课,去医院
周三早上还没开机,就被人事处的人辗转了几个人找到我,改博士后的资料。
周三跑到ZH学院,求爷爷告奶奶地要资料补充博士后的数据(MD,又不是我要申报的),又找LX帮忙,忙到半夜两、三点。
周四上课,晚上到两三点写创新实验的汇报总结、做PPT。
周五上午,到教务处聆听了三个小时的各种课程汇报。下午去医院。
周末,到地里看了看材料。
本周一:
上午一二节上课,三四节和LX讨论文章的数据如何处理;下午给DXQ、GZX改论文,改到头发麻为止;
今天(周二)应做还没做的事情有:
1 给WL、LXX改论文(几乎要重写一遍);
2 给WH看留学申请;
3 帮C审一篇稿件;
4 帮C修改一个资料(还没拿到,不知道要弄成什么样子)
5 备周三的四节课。
吐血。。。
吐完了继续前进》》》